MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018186	CGG	2	6	14	19	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018186	ACC	2	6	428	433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018186	ACT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018186	CCCA	2	8	710	717	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_018186	TCT	2	6	1435	1440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018186	CAA	2	6	1487	1492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018186	TGT	2	6	1502	1507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018186	GGC	2	6	1508	1513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018186	GC	3	6	1633	1638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018186	CGG	2	6	1679	1684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018186	ACT	2	6	1918	1923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018186	CAA	2	6	2099	2104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018186	T	6	6	2135	2140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018186	GC	3	6	2149	2154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018186	T	6	6	2200	2205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018186	TGC	2	6	3096	3101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018186	AGC	2	6	3133	3138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018186	CCGCT	2	10	3297	3306	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_018186	GCTC	2	8	3457	3464	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018186	AAGGT	2	10	3479	3488	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018186	TTG	2	6	3775	3780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018186	TTC	2	6	3827	3832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018186	CGT	2	6	3916	3921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018186	AC	3	6	3944	3949	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018186	A	6	6	3988	3993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018186	CA	3	6	4016	4021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018186	AAG	2	6	4041	4046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018186	TGTT	2	8	6353	6360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.